防止微生物污染的方法通常是采取有效的殺菌處理措施，有氯氣及NaClO,ClO2,KMnO4,H22O2、O3、紫外線照射等常規(guī)方法，控制重點(diǎn)是選取合適的殺菌劑，足夠長的接觸時(shí)間。對于氯類殺菌劑，投加量一般以進(jìn)水余氯含量>1mg/L為準(zhǔn)，根據(jù)不同的反滲透膜控制合適的殘余氯量。另外還可以采用氧化性和非氧化性殺菌劑(如Na2S2O5、NaHSO350mg/L，異噻唑啉酮15-25mg/L)定期、交替沖擊性、大劑量殺菌，可殺滅系統(tǒng)中大部分微生物，甚至可以穿透粘附于系統(tǒng)中的生物粘泥膜，起到殺滅、剝離作用。再就是嚴(yán)格控制給水中的有機(jī)物含量(以總有機(jī)碳TOC表示不超過2mg/L)，抑制細(xì)菌的生長繁殖。最好同時(shí)注意監(jiān)測反滲透系統(tǒng)各環(huán)節(jié)的水中細(xì)菌總數(shù)(TBC)以便有效的預(yù)防，當(dāng)發(fā)現(xiàn)有徽生物污染的癥狀時(shí)(壓差升高10%，產(chǎn)水量降低10%)應(yīng)及時(shí)采取清洗措施(包括對預(yù)處理系統(tǒng)和RO系統(tǒng)的清洗)，以免污染加重。定期殺菌，一般采用1%-3%的甲醛溶液沖洗15min，殺死細(xì)菌。在RO系統(tǒng)停用期間，要求用甲醛，每2天洗1次。除采用甲醛以外，還可采用0.2%的H22O2進(jìn)行殺菌。

一般認(rèn)為，經(jīng)過活性炭處理過的水中會(huì)含有大量微生物。但對于活性炭處理工藝,只要調(diào)整好反洗頻率及更換頻次,也可以防止微生物污染。

（1）在反滲透水處理系統(tǒng)中反滲透膜的微生物污染在各種膜污染中是最嚴(yán)重的。它具有發(fā)展迅速，形成的生物膜難于徹底清除等特點(diǎn)，易堵塞膜，導(dǎo)致反滲透系統(tǒng)進(jìn)出水間壓差迅速增大，產(chǎn)水量與脫鹽率快速下降，可能污染產(chǎn)品水，甚至損壞膜。

（2）可以通過監(jiān)測濃水細(xì)菌總數(shù)（TBC）值的變化和給水的總有機(jī)碳（TOC）值來對微生物污染進(jìn)行預(yù)測，并可以通過燃燒污染物來簡易判斷是否是微生物污染。

  （3）要加強(qiáng)對地下水作為原水時(shí)預(yù)處理消毒殺菌的重視，防止在RO裝置中出現(xiàn)微生物污染。

  （4）對微生物污染的防治除常規(guī)方法外，還可以采用氧化性和非氧化性殺菌劑定期、交替沖擊性、大劑量殺菌。嚴(yán)格控制給水中的有機(jī)物含量(以總有機(jī)碳TOC表示不超過2mg/L)，抑制細(xì)菌的生長繁殖。對于活性炭處理工藝,只要調(diào)整好反洗頻率及更換頻次,也可以防止微生物污染。